Η χρήση φυτοπροστατευτικών προϊόντων χωρίς την απαραίτητη συνταγή επισύρει πρόστιμο που μπορεί να φτάσει έως και τα 5000 ευρώ. Σε ορισμένες περιπτώσεις, επιφέρει ακόμη και περικοπή ή πλήρη απώλεια των δικαιωμάτων ενίσχυσης, ιδίως όταν η παράβαση συνιστά παραβίαση των υποχρεώσεων πολλαπλής συμμόρφωσης που ορίζει η ΚΑΠ.
Η χρήση χωρίς νόμιμη συνταγή ή από μη πιστοποιημένο άτομο, μπορεί να ενεργοποιήσει ελέγχους από φορείς όπως ο ΟΠΕΚΕΠΕ, ο ΕΛΓΟ ή οι ΔΑΟΚ, οι οποίοι έχουν τη δυνατότητα να επιβάλουν διοικητικά πρόστιμα, να περικόψουν μέρος των επιδοτήσεων (π.χ. βασική ενίσχυση, οικολογικά σχήματα) ή και να προχωρήσουν σε ολική απώλεια των δικαιωμάτων ενίσχυσης σε περιπτώσεις σοβαρών ή επαναλαμβανόμενων παραβάσεων.
Εάν την εφαρμογή την πραγματοποιεί άτομο που δε διαθέτει πιστοποίηση, το πρόστιμο ξεκινά από τα 500 ευρώ και μπορεί να φτάσει έως και τα 2000, ανάλογα τη βαρύτητα της παράβασης. Αντίστοιχα, ο γεωπόνος που προχωρά σε πώληση χωρίς να έχει συντάξει νόμιμη συνταγή, λαμβάνει διοικητικό πρόστιμο και επαγγελματικές κυρώσεις. Τέλος, ο ψεκασμός χωρίς αποδείξεις ή χωρίς καταγραφή στο Ηλεκτρονικό Σύστημα Συνταγογράφησης, μπορεί να οδηγήσει σε περικοπές των πληρωμών από το ΟΣΔΕ ή από δράσεις οικολογικής διαχείρισης.
