Από την εφαρμογή της ψηφιακής παρακολούθησης διακίνησης αγαθών, εξαιρούνται αγρότες ειδικού καθεστώτος ΦΠΑ και φυσικά πρόσωπα που πωλούν προϊόντα ή υπηρεσίες ευκαιριακά (συναλλαγές έως 10.000€). Σε σεμινάριο του Οικονομικού Επιμελητηρίου Ελλάδος, σχετικά με το ψηφιακό δελτίο αποστολής, τονίστηκε ότι εφόσον ο εκδότης δεν γνωρίζει την ακριβή ποσότητα του προϊόντος (στο χωράφι), έχει στην πρώτη φάση προστεθεί σκοπός διακίνησης προς ζύγιση με συμπλήρωση της ποσότητας κατά προσέγγιση, ενώ η τελική ζυγιζόμενη ποσότητα θα προστεθεί στη 2η φάση, ως υποχρέωση του λήπτη κατά τον ποιοτικό και ποσοτικό έλεγχο.
Επίσης, όπως υποστηρίζει η ΑΑΔΕ, θα επιτρέπει με σχετική εγκύκλιο την έκδοση χειρόγραφου δελτίου αποστολής, μόνο στις περιπτώσεις που δεν υπάρχει δίκτυο ή ρεύμα, καθώς χωρίς δίκτυο δε θα υπάρχει δυνατότητα έκδοσης ούτε από το κινητό, ενώ το χειρόγραφο θα μπορεί να διαβιβάζεται. Η διακίνηση αγαθών χωρίς ψηφιακό δελτίο αποστολής, επιφέρει αυστηρό πρόστιμο, 500€ ανά φορολογικό έλεγχο για τήρηση απλογραφικού και 1.000€ για τήρηση διπλογραφικού συστήματος. Η ανακοίνωση του υπουργείου για πρόστιμα 5.000€ και 10.000€ ακόμη δεν έχει νομοθετηθεί.
